La pellagre est une maladie de carence en vitamines causée le plus souvent par un manque chronique de niacine (vitamine B3 ou vitamine PP, issue du facteur de prévention de la pellagre) dans l'alimentation. Cela peut être dû à une diminution de la consommation de niacine ou de tryptophane, et éventuellement à une consommation excessive de leucine. Cela peut également résulter d'altérations du métabolisme protéique dans des troubles tels que le syndrome carcinoïde ou la maladie de Hartnup. Une carence en lysine, un acide aminé, peut également entraîner une carence en niacine.