Les 4 principales classes de médicaments actuellement utilisées pour traiter le paludisme comprennent les composés liés à la quinoléine, les antifolates, les dérivés de l'artémisinine et les antimicrobiens. Aucun médicament capable d'éradiquer toutes les formes du cycle de vie du parasite n'a encore été découvert ou fabriqué. Par conséquent, une ou plusieurs classes de médicaments sont souvent administrées en même temps pour lutter de manière synergique contre l’infection palustre.
Les schémas thérapeutiques dépendent de l'emplacement géographique de l'infection, de l'espèce probable de Plasmodium et de la gravité de la présentation de la maladie.