La pathologie clinique concerne le diagnostic d'une maladie basé sur l'analyse en laboratoire de fluides corporels comme l'urine et le sang. Il traite des outils de la microbiologie comme les macroscopiques, les microscopiques, les analyseurs et les cultures. Il couvre la microbiologie, l'interaction hôte-pathogène et l'immunologie liées aux agents infectieux, notamment les bactéries, les champignons, les virus et les protozoaires. Il accepte également des articles dans le domaine de la microbiologie clinique, à l'exception des rapports de cas. La pathogenèse d'une maladie est le mécanisme biologique qui conduit à l'état maladif. Il décrit également l'origine et l'évolution de la maladie, et indique si elle est aiguë, chronique ou récurrente.
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