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Volume 7, Problème 5 (2022)

Commentaire

Modèle spécifique de méthylation de l'ADN dans la lampe à lampe à poulet

À Veniamin

Impliquée dans le contrôle de la transcription et de la réplication, la reprogrammation du développement, le silençage des rétroéléments et d'autres activités génomiques, la méthylation de l'ADN est un mécanisme de régulation épigénétique crucial. Pour que le développement embryonnaire se produise au cours du développement des mammifères, un certain modèle de méthylation de l'ADN dans les cellules germinales doit être créé. Chez d'autres animaux, la méthylation de l'ADN dans les cellules germinales est moins bien comprise. Nous avons examiné le méthylome unicellulaire des ovocytes diplotènes de poulet pour combler cette lacune. Nous avons développé une segmentation basée sur la méthylation du génome du poulet et découvert des promoteurs de gènes méthylés exclusifs aux ovocytes après avoir caractérisé en profondeur les modèles de méthylation dans ces cellules. Nos résultats démontrent que les modèles de méthylation dans ces cellules reflètent étroitement la distribution chromosomique observée dans les tissus somatiques, malgré la création d'une architecture génomique particulière hyperactive sur le plan transcriptionnel dans les ovocytes diplotènes de poulet.

Mini-revue

Développement de marqueurs moléculaires dans les espèces médicinales de sauge

Yang Liu

Nous avons utilisé la technologie Illumina Hiseq 2500 pour séquencer les génomes chloroplastiques de Salvia bowleyana , S. splendens et S. officinalis afin d'établir de manière approfondie leurs relations évolutives et de créer des marqueurs moléculaires pour la classification des espèces. S. bowleyana , S. splendens et S. officinalis avaient tous des génomes chloroplastiques d'une longueur respective de 151 387, 150 604 et 151 163 paires de bases. Les zones IR contenaient les six gènes ndhB, rpl2, rpl23, rps7, rps12 et ycf2. Il existe 29 répétitions en tandem, 35 répétitions de séquences simples, 24 répétitions de séquences simples et 47, 49, 40 répétitions intercalées dans les génomes chloroplastiques de S. bowleyana , S. splendens et S. officinalis , respectivement. Les 23 espèces de Salvia ont pu être distinguées par les trois séquences intergéniques distinctes (IGS) de rps16-trnQ-UUG, trnL-UAA-trnF-GAA et trnM-CAU-atpE. L'analyse de la distance génétique a permis l'identification de 91 séquences d'espaceurs intergéniques au total. Les deux zones IGS spécifiques (ycf3-trnS-GGA et trnG-GCC-trnM-CAU) présentent les valeurs K2p les plus élevées parmi les trois espèces de Salvia étudiées. L'arbre phylogénétique a également démontré que les 23 espèces de Salvia formaient un groupe monophylétique. La découverte de deux ensembles d'amorces de codes-barres d'ADN spécifiques au genre. Les résultats donneront une base solide pour comprendre comment les trois espèces de Salvia sont classées phylogénétiquement. De plus, les régions intergéniques uniques peuvent offrir le potentiel de distinguer les espèces de Salvia en fonction à la fois du phénotype et de la différenciation des segments de gènes.

Communication courte

Connexions de l'ADN avec le lysozyme

Nikolaï Noskov

L'AFM, l'ellipsométrie, la tensiométrie de surface, la rhéologie dilatée de surface et la spectroscopie d'absorption-réflexion infrarouge (IRRAS) ont été utilisées pour étudier les interactions de l'ADN avec le lysozyme dans la couche de surface (AFM). Sous une couche de lysozyme dispersée, une sous-phase aqueuse a été injectée avec une solution d'ADN concentrée. Contrairement aux interactions de l'ADN avec une monocouche d'un polyélectrolyte synthétique cationique, où les propriétés optiques de la couche de surface ont changé rapidement après l'injection d'ADN, l'élasticité de surface dilatée dynamique n'a presque pas changé. Cela suggère qu'aucun réseau continu de complexes ADN/lysozyme ne s'est formé. L'augmentation relativement rapide des signaux optiques suite à une injection d'ADN derrière une couche de lysozyme suggère que la diffusion régule la pénétration de l'ADN. Les images AFM démontrent le développement de longs brins dans la couche de surface à de faibles pressions de surface. Contrairement à une couche mixte d'ADN et de polyélectrolytes synthétiques, une compression de surface accrue entraîne l'émergence de plis et de crêtes plutôt qu'un réseau d'agrégats ADN/lysozyme. Il est probable que des interactions plus faibles entre le lysozyme et l'ADN duplex et la stabilisation des boucles de nucléotides non appariés à des concentrations locales élevées de lysozyme dans la couche superficielle soient les causes de la création d'agrégats plus désordonnés.

Mini-revue

Les récepteurs d'immunoglobuline et l'antigène C augmentent le risque de rejet hépatique chronique

Miguel Bolarín

L'élimination hépatique continue (EC) aborde la question du fait que de nombreux patients ne répondent pas à une immunosuppression accrue. Les interactions récepteurs de type immunoglobuline des cellules souches embryonnaires/antigènes leucocytaires humains de classe I (KIR/HLA-I) semblent anticiper l'alloréactivité des cellules souches embryonnaires normales (NK) et affecter l'élimination intense de l'allogreffe hépatique. Cependant, son importance dans l'élimination hépatique continue reste discutable. Les génotypes KIR et HLA ont été étudiés dans 513 greffes hépatiques en utilisant des techniques d'oligonucléotides spécifiques à l'ADN (PCR-SSO). Les KIR, les génotypes de l'antigène leucocytaire humain C (HLA-C), les complexes de gènes KIR et le ligand KIR/HLA ont été examinés et comparés dans les greffes générales et l'EC (n=35) et l'absence d'élimination continue (NCR=478). Français L'activation des qualités KIR (aKIR) chez les bénéficiaires (rKIR2DS2+ et rKIR2DS3+) a augmenté les taux de CR par rapport aux groupes NCR (p = 0,013 et p = 0,038). Les qualités KIR inhibitrices (iKIR) chez les bénéficiaires rKIR2DL2+ ont fondamentalement augmenté le taux de CR par rapport à leur non-participation (9,1 % contre 3,7 %, p = 0,020). KIR2DL3 augmente fondamentalement la CR (13,1 % contre 5,2 % ; p = 0,008). Il n'y a eu aucun impact sur la NCR. La CR a été observée dans les confusions HLA-I (MM). Le manque de ligand donneur (d) HLA-C2 (dC2−) augmente la CR concernant leur présence (13,1 % contre 5,6 % ; p = 0,018). Une augmentation considérable de CR a été observée dans rKIR2DL3+/dC1−(p=0,015), rKIR2DS4/dC1−(p=0,014) et rKIR2DL3+/rKIR2DS4+/dC1−(p=0,006).

L'endurance des patients à long terme était fondamentalement plus faible dans le groupe rKIR2DS1+rKIR2DS4+/dC1− à 5-10 ans après la réinstallation. Cette étude montre l'impact des mélanges rKIR/dHLA-C et des mélanges de qualité aKIR dans l'expansion des ligands CR et KIR2DS1+/C1 et l'impact des ligands KIR2DS4+/C1 dans l'endurance à long terme des liaisons.

Perspective

Estimation d'une étude préliminaire de la microstructure de l'os trabéculaire mandibulaire

Mohd Youssef

L'objectif de cette étude est double : premièrement, associer les caractéristiques de chacune des limites de la microstructure osseuse trabéculaire (TBM) à l'âge et au sexe séquentiels de la personne, puis travailler avec l'évaluation des changements probables liés à l'âge et au sexe dans les limites de la microstructure osseuse trabéculaire dans la mandibule ; et deuxièmement, évaluer les limites de la microstructure trabéculaire correspondant à l'âge ordonné. Vingt contrôles tomographiques enregistrés par cône-barre (CBCT) ont été récupérés de manière réflexive à partir d'un ensemble de données de patients adultes âgés de 22 à 43 ans. Dans la mandibule, le volume d'intérêt comprenait l'espace interdentaire entre la deuxième prémolaire mandibulaire et la première molaire mandibulaire, ainsi que l'espace trabéculaire sous et entre les apex. À l'aide du logiciel Analyze Direct 14.0, les images DICOM des examens CBCT ont été prétraitées, modifiées, divisées à l'aide d'une méthode intelligente de limite d'autochargeur dirigée et mesurées. De plus, les limites TBM ont été déduites et une enquête mesurable a été menée en utilisant un test de corrélation de Pearson à deux queues. Toutes les limites n'ont montré aucune différence vraiment énorme (p> 0,05) entre l'âge ordonné et le sexe. Des relations négatives critiques mesurables ont été trouvées entre Tb. N (r = −0,489), BS/TV (r = −0,527) et l'âge séquentiel (p = 0,029 et p = 0,017, individuellement). Seuls Tb. N et BS/TV ont montré une relation opposée avec l'âge séquentiel. Diverses études ont évalué la structure trabéculaire des os de la mâchoire, mais aucune n'a trouvé de lien entre les limites trabéculaires mesurées et l'âge ordonné. Les gravures informatisées créées par imagerie radiographique peuvent servir de profils organiques pour la collecte de données.

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