Journal de médecine légale

Développement de marqueurs moléculaires dans les espèces médicinales de sauge

Abstract

Yang Liu

Nous avons utilisé la technologie Illumina Hiseq 2500 pour séquencer les génomes chloroplastiques de Salvia bowleyana , S. splendens et S. officinalis afin d'établir de manière approfondie leurs relations évolutives et de créer des marqueurs moléculaires pour la classification des espèces. S. bowleyana , S. splendens et S. officinalis avaient tous des génomes chloroplastiques d'une longueur respective de 151 387, 150 604 et 151 163 paires de bases. Les zones IR contenaient les six gènes ndhB, rpl2, rpl23, rps7, rps12 et ycf2. Il existe 29 répétitions en tandem, 35 répétitions de séquences simples, 24 répétitions de séquences simples et 47, 49, 40 répétitions intercalées dans les génomes chloroplastiques de S. bowleyana , S. splendens et S. officinalis , respectivement. Les 23 espèces de Salvia ont pu être distinguées par les trois séquences intergéniques distinctes (IGS) de rps16-trnQ-UUG, trnL-UAA-trnF-GAA et trnM-CAU-atpE. L'analyse de la distance génétique a permis l'identification de 91 séquences d'espaceurs intergéniques au total. Les deux zones IGS spécifiques (ycf3-trnS-GGA et trnG-GCC-trnM-CAU) présentent les valeurs K2p les plus élevées parmi les trois espèces de Salvia étudiées. L'arbre phylogénétique a également démontré que les 23 espèces de Salvia formaient un groupe monophylétique. La découverte de deux ensembles d'amorces de codes-barres d'ADN spécifiques au genre. Les résultats donneront une base solide pour comprendre comment les trois espèces de Salvia sont classées phylogénétiquement. De plus, les régions intergéniques uniques peuvent offrir le potentiel de distinguer les espèces de Salvia en fonction à la fois du phénotype et de la différenciation des segments de gènes.