Journal d'informatique et de biologie des systèmes

Instructions pour les auteurs

Le Journal of Computer Science & Systems Biology propose la publication bimensuelle rapide d'articles dans tous les domaines liés à l'informatique et à la biologie des systèmes. Le Journal of Computer Science & Systems Biology accueille favorablement la soumission de manuscrits qui répondent aux critères généraux d’importance et d’excellence scientifique. Les documents seront publiés environ un mois après acceptation.

Les domaines fonctionnels clés de la revue comprennent l'intelligence artificielle, la robotique, la biologie des systèmes végétaux, la biologie des systèmes du cancer, GenHILARIS SRL évolutif, la biologie computationnelle, la biologie mathématique, la biostatique, la biologie des systèmes cellulaires, le modèle stachiostique, la modélisation biologique, la biologie des systèmes moléculaires, le réseau neuronal, Réseaux sans fil, science informatique, etc.
En tant que membre de la Publisher International Linking Association, PILA, Journal of Computer Science & Systems Biology (de HILARIS SRL) suit la licence d'attribution Creative Commons et les politiques de publication en libre accès de Scholars.

Soumettez le manuscrit à  https://www.scholarscentral.org/submissions/computer-science-systems-biology.html  ou envoyez-le sous forme de pièce jointe par courrier électronique au bureau éditorial à editor@hilarispublisher.com

Un numéro de manuscrit sera envoyé par courrier électronique à l'auteur correspondant dans les 72 heures.

Remarque : Les auteurs sont seuls responsables de toute mauvaise conduite scientifique, y compris le plagiat dans leurs articles de recherche ; L'éditeur n'est pas responsable de toute mauvaise conduite scientifique survenue dans un article de recherche publié. En tant qu'éditeur, nous suivrons strictement les directives scientifiques et les conseils de l'EIC pour retirer ou erratum de tout article à tout moment si une mauvaise conduite scientifique ou des erreurs se sont produites dans un article.

Politique de HILARIS SRL concernant le mandat du NIH

HILARIS SRL soutiendra les auteurs en publiant la version publiée des articles des titulaires de subventions du NIH et des titulaires de subventions biomédicales ou des sciences de la vie basés en Europe ou au Royaume-Uni sur PubMed Central immédiatement après la publication.

Politiques et processus éditoriaux

Le Journal of Computer Science & Systems Biology suit une politique éditoriale progressiste qui encourage les chercheurs à soumettre les recherches originales, les critiques et les observations éditoriales sous forme d'articles, bien étayés par des tableaux et une représentation graphique.

Frais de traitement des articles (APC) : 

Le délai moyen de traitement des articles (APT) est de 55 jours

Service de publication rapide

Hilaris Publishing offre un large éventail d'opportunités, d'options et de services aux auteurs potentiels pour publier leurs contributions scientifiques.

La revue répond aux exigences de publication rapide sans compromettre la qualité éditoriale, y compris l'évaluation par les pairs des manuscrits. Cette flexibilité est fournie pour garantir la crédibilité des premiers auteurs à leurs contributions respectives et cela garantira également une diffusion en temps opportun des résultats de la recherche pour une intégration efficace, une traduction efficace et une redondance réduite.

Les auteurs ont la possibilité de choisir entre le service de publication standard en libre accès qui prend son propre temps pour terminer le processus de publication ou peuvent opter pour un service de publication rapide dans lequel l'article est publié le plus tôt possible (comprend plusieurs experts en la matière mandatés pour obtenir le plus tôt possible des pairs). -examiner les commentaires). Les auteurs peuvent bénéficier de cette flexibilité en fonction de leurs préférences personnelles, des directives de l'agence de financement ou des exigences institutionnelles ou organisationnelles.

Quelle que soit l’option choisie, tous les manuscrits sont soumis à un processus approfondi d’examen par les pairs, d’évaluation éditoriale et de production.

Processus rapide d'exécution et de révision éditoriale (processus de révision FEE)

Les auteurs qui souhaitent publier leurs articles sous ce mode peuvent effectuer un pré-paiement de 99 $ pour une évaluation expresse par les pairs et une décision éditoriale. Première décision éditoriale dans 3 jours et décision finale avec commentaires de révision dans 5 jours à compter de la date de soumission. La génération des épreuves en galerie sera effectuée dans les 2 jours suivant l'acceptation ou dans un délai maximum de 5 jours (pour les manuscrits notifiés pour révision par un évaluateur externe).

Les manuscrits acceptés pour publication seront facturés au tarif APC régulier.

Les auteurs conservent les droits d'auteur de leur publication et la version finale de l'article sera publiée aux formats HTML et PDF ainsi qu'aux formats XML pour transmission aux bases de données d'indexation. L'équipe éditoriale de la Revue veillera au respect des directives de publication scientifique.

Le Journal of Computer Science & Systems Biology est organisé par HILARIS SRL, une organisation autonome et ne reçoit de financement d'aucune institution/gouvernement. Par conséquent, le fonctionnement de la Revue est uniquement financé par les frais de traitement reçus des auteurs et de certains sponsors universitaires/entreprises. Les frais de dossier sont nécessaires pour assurer la maintenance du journal. Étant une revue en libre accès, le Journal of Computer Science & Systems Biology ne reçoit pas de paiement pour l'abonnement, car les articles sont librement accessibles sur Internet. Les auteurs d’articles sont tenus de payer des frais de traitement équitables pour le traitement de leurs articles. Cependant, il n'y a pas de frais de soumission. Les auteurs ne sont tenus d'effectuer le paiement qu'après que leur manuscrit a été accepté pour publication. Les frais de traitement de base des articles ou les frais de traitement des manuscrits sont conformes au prix mentionné ci-dessous. En revanche, cela peut varier en fonction de l'édition approfondie, des effets de couleur, des équations complexes, de l'allongement supplémentaire du numéro ou des pages de l'article, etc.  

Soumission d'un article Afin de réduire les délais, les auteurs doivent respecter le niveau, la longueur et le format des revues HILARIS SRL à chaque étape du traitement, depuis la soumission du manuscrit jusqu'à chaque étape de révision. Les articles soumis doivent comporter un résumé/résumé de 300 mots, distinct du texte principal. Le résumé doit fournir un bref compte rendu des travaux en indiquant clairement l'objectif de l'étude et la méthodologie adoptée, en soulignant brièvement les principales conclusions. Le texte peut contenir quelques sous-titres courts de 40 caractères maximum chacun.

Formats pour les contributions de HILARIS SRL HILARIS SRL accepte divers formats d'œuvres littéraires tels que des articles de recherche, des critiques, des résumés, des addendums, des annonces, des commentaires d'articles, des critiques de livres, des communications rapides, des lettres à l'éditeur, des résumés de réunions annuelles, des actes de conférence, des calendriers, rapports de cas, corrections, discussions, rapports de réunions, actualités, nécrologies, discours, critiques de produits, hypothèses et analyses.

Directives pour la préparation des articles

• Les auteurs doivent joindre une lettre d'accompagnement électronique mentionnant complètement le type de manuscrit (par exemple, article de recherche, articles de revue, rapports succincts, étude de cas, etc.). À moins d'être invités dans un cas particulier, les auteurs ne peuvent pas classer un manuscrit particulier comme éditoriaux ou lettres à l'éditeur ou des communications concises.
• Confirmez que chaque personne nommée comme auteur répond aux exigences uniformes des critères de paternité du Journal of Computer Science & Systems Biology.
• Veuillez vous assurer que l'article soumis pour révision/publication n'est pas en cours d'examen ailleurs simultanément.
• Mentionnez clairement le soutien financier ou les avantages éventuels provenant de sources commerciales pour le travail rapporté dans le manuscrit, ou tout autre intérêt financier que l'un des auteurs pourrait avoir, ce qui pourrait créer un conflit d'intérêts potentiel ou l'apparence d'un conflit d'intérêts en ce qui concerne au travail.
• Un titre clair de l'article ainsi que des détails complets sur le ou les auteurs (affiliation professionnelle/institutionnelle, diplômes et coordonnées) doivent être fournis dans la page de vignette.
• L'auteur correspondant doit inclure son adresse, son numéro de téléphone, son numéro de fax et son adresse e-mail sur la première page du manuscrit et les auteurs doivent résoudre tout conflit d'intérêts avec d'autres une fois l'article publié.
• Numérotez successivement toutes les feuilles, y compris les références, les tableaux et les légendes des figures.
• La page de titre est la page 1. Sur la première page, tapez le titre courant (titre court en haut de chaque page), le titre (qui ne peut inclure aucun acronyme), les noms des auteurs et leurs diplômes universitaires, subventions ou autres soutiens financiers du étude, adresse pour la correspondance et les demandes de réimpression, ainsi que les numéros de téléphone et de fax et l'adresse e-mail de l'auteur correspondant.

Lignes directrices pour les articles de recherche

• Les articles de recherche sont des articles rédigés sur la base de données empiriques/secondaires collectées à l'aide d'une méthodologie de recherche clairement définie, où des conclusions sont tirées de l'analyse des données collectées.
• Les informations doivent être basées sur des recherches originales qui s’ajoutent à l’ensemble des connaissances en informatique et biologie des systèmes.
• Les articles doivent fournir une description ou une analyse critique des données présentées tout en ajoutant de nouveaux domaines en évolution rapide dans le domaine.
• Incluez un résumé de 300 mots maximum avec 7 à 10 mots-clés importants.
• Le résumé doit être divisé en objectif, méthodes, résultats et conclusion.
• Les articles de recherche doivent respecter un format constituant une introduction suivie d'un bref examen de la littérature pertinente, de la méthodologie appliquée (pour collecter les données), d'une discussion et de références, de tableaux et de légendes de figures.

Articles de revue

• Les articles de revue sont rédigés principalement sur la base de données secondaires qui correspondent au thème de la revue. Il s’agit de discussions brèves mais critiques sur un aspect spécifique du sujet concerné. Les critiques commencent généralement par l'énoncé du problème avec un bref résumé de 300 mots et quelques mots clés. L'introduction présente généralement la question aux lecteurs, suivie d'une discussion analytique à l'aide des tableaux, graphiques, images et illustrations nécessaires lorsque cela est nécessaire. Il résume le sujet avec une conclusion. Toutes les déclarations ou observations contenues dans les articles de synthèse doivent être basées sur les citations nécessaires, fournissant une référence complète à la fin de l'article.

Commentaires

• Les commentaires sont des articles d'opinion rédigés principalement par des écrivains chevronnés et expérimentés sur un développement spécifique, une innovation récente ou des résultats de recherche qui correspondent au thème de la revue. Il s'agit d'articles très brefs dont le titre et le résumé donnent l'essentiel du sujet à discuter, avec quelques mots clés. Il expose d'emblée les problèmes et propose une analyse approfondie à l'aide d'illustrations, de graphiques et de tableaux si nécessaire. Il résume le sujet avec une brève conclusion, citant les références à la fin.

Étude de cas

• Les études de cas sont acceptées en vue d'ajouter des informations supplémentaires liées à la recherche d'investigation qui progresse dans le domaine de l'informatique et de la biologie des systèmes.
• Il doit ajouter de la valeur au contenu/article principal soumis, en fournissant des informations clés sur le domaine principal. Les rapports de cas doivent être brefs et suivre un format clair tel qu'une section cas et méthodes (qui décrit la nature du problème clinique et la méthodologie adoptée pour le résoudre), une section de discussion qui analyse le cas et une section de conclusion qui résume l'ensemble du cas. .

Éditoriaux

• Les éditoriaux sont des commentaires concis sur un article/numéro actuellement publié sur l'informatique et la biologie des systèmes. Le bureau éditorial peut faire appel à de telles œuvres et les auteurs doivent les soumettre dans les trois semaines à compter de la date de réception de l'invitation.

Images cliniques

• Les images cliniques ne sont rien d'autre que des représentations photographiques de l'informatique et de la biologie des systèmes et ne doivent pas dépasser 5 chiffres avec une description, ne dépassant pas 300 mots. Généralement, aucune référence ni citation n’est requise ici. Si nécessaire, seules trois références peuvent être autorisées.
• N'ajoutez pas de légendes de figures distinctes aux images cliniques ; l'intégralité du texte de l'image clinique constitue la légende de la figure. Les images doivent être soumises avec le manuscrit dans l'un des formats suivants : .tiff (de préférence) ou .eps.

Lettres à l'éditeur/Communications concises

• Les lettres adressées à l'éditeur doivent se limiter à des commentaires sur des articles antérieurs publiés avec une référence spécifique aux problèmes et aux causes qui s'y rapportent. Il doit s’agir de rapports concis, complets et brefs sur des cas ou des résultats de recherche. Il ne suit pas de format tel qu'un résumé, des sous-titres ou des remerciements. Il s'agit plutôt d'une réponse ou de l'opinion du lecteur sur un article particulier publié et doit parvenir à l'éditeur dans les 6 mois suivant la publication de l'article.

Remerciements : cette section comprend les remerciements des personnes, les détails de la subvention, les fonds, etc.

Remarque : Si un auteur ne soumet pas son travail conformément aux instructions ci-dessus, il lui est demandé de conserver des titres clairs, à savoir les titres et les sous-titres.

Références : seuls les manuscrits publiés ou acceptés doivent être inclus dans la liste de références. Les résumés de réunions, les conférences ou les articles soumis mais non encore acceptés ne doivent pas être cités. Toutes les communications personnelles doivent être appuyées par une lettre des auteurs concernés. HILARIS SRL utilise la méthode de citation numérotée (citation-séquence). Les références sont répertoriées et numérotées dans l'ordre dans lequel elles apparaissent dans le texte. Dans le texte, les citations doivent être indiquées par le numéro de référence entre parenthèses. Les citations multiples au sein d’un même ensemble de parenthèses doivent être séparées par des virgules. Lorsqu’il y a trois citations séquentielles ou plus, elles doivent être données sous forme de plage. Exemple : "... permettent désormais aux biologistes de surveiller simultanément l'expression de milliers de gènes au cours d'une seule expérience [1,5-7,28]". Assurez-vous que les parties du manuscrit sont dans le bon ordre pour la revue concernée avant de classer les citations. Les légendes des figures et les tableaux doivent se trouver à la fin du manuscrit. Les auteurs sont priés de fournir au moins un lien en ligne pour chaque référence comme suit (de préférence PubMed). Étant donné que toutes les références seront liées électroniquement autant que possible aux articles qu'elles citent, un formatage approprié des références est crucial. Veuillez utiliser le style suivant pour la liste de références : Exemples d'articles publiés

1. Laemmli UK (1970) Clivage de protéines structurales lors de l'assemblage de la tête du bactériophage T4. Nature 227 : 680-685.
2. Brusic V, Rudy G, Honeyman G, Hammer J, Harrison L (1998) Prédiction des peptides de liaison au CMH de classe II à l'aide d'un algorithme évolutif et d'un réseau neuronal artificiel. Bioinformatique 14 : 121-130.
3. Doroshenko V, Airich L, Vitushkina M, Kolokolova A, Livshits V et al. (2007) YddG d'Escherichia coli favorise l'exportation d'acides aminés aromatiques. FEMS Microbiol Lett 275 : 312-318.

Remarque : Veuillez énumérer les cinq premiers auteurs, puis ajouter « et al. » s'il y a des auteurs supplémentaires. Articles de revues électroniques Entrez Programming Utilities
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK25500/ 

Livres

1. Baggot JD (1999) Principes d'élimination des médicaments chez les animaux domestiques : les bases de la pharmacologie clinique vétérinaire. (1stedn), WB Saunders Company, Philadelphie, Londres, Torante.
2. Zhang Z (2006) Outils bioinformatiques pour l'analyse différentielle des données de profilage d'expression protéomique à partir d'échantillons cliniques. Presse Taylor et Francis CRC.

Conférences

1. Hofmann T (1999) Le modèle d'abstraction de cluster : apprentissage non supervisé des hiérarchies de sujets à partir de données textuelles. Actes de la Conférence internationale conjointe sur l'intelligence artificielle.

Tableaux Ceux-ci doivent être utilisés au minimum et conçus aussi simplement que possible. Nous encourageons fortement les auteurs à soumettre des tableaux au format .doc. Les tableaux doivent être dactylographiés à double interligne, y compris les titres et les notes de bas de page. Chaque tableau doit figurer sur une page séparée, numérotée consécutivement en chiffres arabes et accompagnée d'un en-tête et d'une légende. Les tableaux doivent être explicites sans référence au texte. De préférence, les détails des méthodes utilisées dans les expériences devraient être décrits dans la légende plutôt que dans le texte. Les mêmes données ne doivent pas être présentées à la fois sous forme de tableau et de graphique, ni répétées dans le texte. Les cellules peuvent être copiées à partir d'une feuille de calcul Excel et collées dans un document Word, mais les fichiers Excel ne doivent pas être intégrés en tant qu'objets.

Remarque : Si la soumission est au format PDF, l'auteur est prié de la conserver au format .doc afin de faciliter la réussite du processus.

Figures Les formats de fichiers préférés pour les images photographiques sont .doc, TIFF et JPEG. Si vous avez créé des images avec des composants séparés sur différents calques, veuillez nous envoyer les fichiers Photoshop. Toutes les images doivent être égales ou supérieures à la taille d'affichage prévue, avec les résolutions d'image suivantes : dessin au trait 800 dpi, combinaison (dessin au trait + demi-teintes) 600 dpi, demi-teinte 300 dpi. Consultez le tableau des spécifications de qualité d’image pour plus de détails. Les fichiers image doivent également être recadrés aussi près que possible de l’image réelle. Utilisez des chiffres arabes pour désigner les chiffres et les lettres majuscules de leurs parties (Figure 1). Commencez chaque légende par un titre et incluez une description suffisante pour que la figure soit compréhensible sans lire le texte du manuscrit. Les informations données dans les légendes ne doivent pas être répétées dans le texte.

Légendes des figures : elles doivent être saisies par ordre numérique sur une feuille séparée.

Tableaux et équations sous forme de graphiques Si les équations ne peuvent pas être codées dans MathML, soumettez-les au format TIFF ou EPS sous forme de fichiers discrets (c'est-à-dire un fichier contenant uniquement les données d'une équation). Ce n'est que lorsque les tableaux ne peuvent pas être codés au format XML/SGML qu'ils peuvent être soumis sous forme de graphiques. Si cette méthode est utilisée, il est essentiel que la taille de la police de toutes les équations et tableaux soit cohérente et lisible dans toutes les soumissions.

Informations supplémentaires Toutes les informations supplémentaires (figures, tableaux et diagramme récapitulatif, etc.) sont fournies sous forme de fichier PDF unique, dans la mesure du possible. Taille du fichier dans les limites autorisées pour les informations supplémentaires. Les images doivent avoir une taille maximale de 640 x 480 pixels (9 x 6,8 pouces à 72 pixels par pouce).

Épreuves et réimpressions Les épreuves électroniques seront envoyées sous forme de pièce jointe à un e-mail à l'auteur correspondant sous forme de fichier PDF. Les épreuves de pages sont considérées comme la version finale du manuscrit et aucune modification ne sera apportée au manuscrit au stade de l'épreuve. Les auteurs peuvent télécharger librement le fichier PDF. Des copies papier des documents sont disponibles sur demande. Veuillez cliquer sur le lien pour les frais. https://www.HILARIS SRLonline.org/pdfs/HILARIS SRL-Group-reprints-order-form.pdf

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