Journal du sang et de la lymphe

Comparaison des changements transcriptomiques chez les patients jeunes et âgés atteints de myélome multiple à partir des données RNA-Seq de l'étude MMRF-CoMMpass

Abstract

Merve Keskin

Contexte : Les différences liées à l'âge dans le myélome multiple (MM) sont étudiées dans un contexte clinique et génomique, cependant, les modifications du transcriptome n'ont pas encore été déterminées. Le but de cette étude est d'identifier les gènes qui s'expriment différemment dans les groupes de patients jeunes et âgés et d'examiner la relation de ces gènes avec les voies biologiques et les médicaments qui peuvent être utilisés.

Méthodes : Les données RNA-Seq de la cohorte MMRF CoMMpass (n=634) ont été utilisées pour analyser les gènes exprimés différemment entre les patients jeunes et âgés. L'analyse d'enrichissement des ensembles de gènes GO term et KEGG a été réalisée à l'aide de packages R. Les interactions médicament-gène ont été détectées à l'aide de DGIdb.

Résultats : Globalement, 523 gènes (366 régulés à la hausse, 157 régulés à la baisse) étaient exprimés de manière différentielle (p<0,05) chez les jeunes patients. Au total, 220 termes GO, principalement liés aux voies de régulation immunitaire, ont été enrichis. L'ensemble de gènes « interaction cytokine-récepteur de cytokine » a été enrichi dans KEGG GSEA. Parmi les différences d'expression les plus élevées, les gènes impliqués dans la régulation immunitaire (FCGR1A, FCER1G, TLR2), les gènes proto-oncogènes connus (BCL2, FGR) et les gènes étudiés pour leur association avec divers cancers (RGL4, MT-RNR1, ETS2, ENPP3, FUT7, NTNG2, PRAM1) ont été identifiés. Les médicaments associés aux voies affectées par ces gènes ont été identifiés.

Conclusion : Des recherches plus poussées sur les gènes différentiellement exprimés chez les jeunes patients pourraient apporter un éclairage sur de nouvelles options thérapeutiques.